A disciplina de Poluição de Águas e Tratamento de Efluentes está enquadrada no grupo das disciplinas de especialização. A poluição da água devido a efeitos antropogénicos é uma realidade incontornável e pode afectar o meio ambiente e a qualidade de vida das populações.

 A disciplina discute os parâmetros que qualidade de água como indicadores da qualidade da água, os mecanismos de transporte e transformação do BOD nas correntes da água. A disciplina inclui conteúdos sobre origem das águas residuais, características e os procedimentos de tratamento.